雞糞發酵作肥料的傳統老辦法是，讓其自然堆積發酵5飛個月，作飼料也要二十天或一個月左右，這樣臭味散發，既污染環境又造成養分大量流失。而用微生物發酵法處理雞糞，不僅能提高雞糞的營養價值，而且成本低廉，操作簡單，易于推廣，因而受到用戶歡迎。用發酵菌液處理，可使發酵過程大大加快，對工廠化大規模處理雞糞特別方便。但不同性能的發酵菌液的差異較大，體現在發酵時間長短不同，發酵菌液用量進而經濟成本不同，發酵操作繁簡程度進而勞動強度不同，發酵成品氣味顏色外觀狀況及菌體蛋白轉化、養分保存與提升情況，即成品品質不同。

    一、快速啟動發酵

    一般在夏季，經微生物發酵劑處理的雞糞堆肥達到無害化指標的堆制時間一般為20天左右，而自然發酵達到這一指標時間常需60天左右。主要是因為微生物的生長繁殖，使物料中物質發酵降解，縮短堆肥達到高溫階段的時間，并延長高溫期。而在冬季尤其是北方，由于氣溫太低，難以啟動發酵，可以在雞糞中添加金寶貝發酵劑微生物，便可快速啟動雞糞發酵。

二、消滅病原微生物

     在微生物菌劑處理雞糞的過程中，畜禽糞便、作物秸稈等有機固體廢棄物的發酵過程中使發酵物溫度快速上升到60-70度以上，高效殺滅有害病菌、病毒、寄生蟲卵和雜草種子，消除惡臭，使 發酵原料中含N、 P的有機物在微生物的作用下可迅速轉化為利于作物吸收的速效養分，并形成大量的腐殖質和微量元素。起到降低土壤容重、促進形成土壤團粒結構、調節土壤PH 值、培肥地力和提高土壤微生物活性、遏制土傳病害、提高作物產量、提升作物品質等功效。，如禽流感病毒，60℃～70℃高溫數分鐘便可致其死亡。

三、去除臭味

     在雞糞中添加微生物菌劑，可以有效祛除惡臭氣體。這主要是由于微生物可以將不含氮、硫的有機物質如苯酚、羧酸、甲醛等被分解為CO2和H20；將含氮的有機物氨化為NH3，NH3可被亞硝化細菌氧化為NO2-，再進一步被硝化細菌氧化為N03-；含硫的惡臭物質經微生物分解釋放出H2S，被硫氧化細菌氧化成為硫酸等，使污染物得以去除。

四、酶活性變化

     雞糞堆積發酵過程中的一切生物化學過程都是在酶的參與下進行的，酶活性大小反映了有機物料堆制中各種生物化學過程的強度。接種微生物菌劑的雞糞堆肥，由于菌劑中含有較多產纖維素酶、蛋白酶、脂肪酶和過氧化氫酶等酶的微生物。因此，其各種酶活性顯著高于自然堆制。

五、增加肥效

    微生物可以分解雞糞中的淀粉、脂類化合物、半纖維素和蛋白質等較易分解的物質以及部分纖維素和少量木質素，其中部分轉化為水溶性碳、氮化合物，同時初期被微生物利用的部分碳、氮源隨著微生物的死亡而被逐漸分解釋放。因此，可以增加糞便中水溶性碳、氮的含量。與雞糞自然發酵相比，由于微生物菌劑產生的各種酶類能催化有機質快速轉化為腐殖態，接種微生物菌劑的堆肥在相同時間里能合成較多腐殖態碳、氮。另一方面，微生物菌劑能產生一些酸性物質，降低雞糞的PH值，減少雞糞發酵過程中氨的揮發，保持較多氮素，提高肥效，保護環境。

六、提高對作物的安全性

     尿酸、NH4+-N是雞糞中主要影響作物正常生長的物質，微生物菌劑能促進堆肥中的氮物質向蛋白氮和NH3+-N轉化，減少NH4+-N的累積，能快速消除或減少致使作物生長障礙的物質。

七、可制作成其他動物的粗飼料

     雞糞干物質中粗蛋白占31%～33%，其中有一半以上是尿酸、尿素、肌酸、氨等非蛋白氮以及雞糞本身含有的粗纖維和墊草中的大量粗纖維。所以雞糞是養殖畜、禽、魚的好飼料，但生雞糞中含有寄生蟲卵及一些有毒物質和病菌，不能用生雞糞直接進行飼喂，必須在雞糞中添加微生物菌劑進行高溫發酵處理，才能成為無毒且營養豐富的飼料。