半個世紀以來，我國化肥施用量大幅度增長，在保證糧食安全方面發揮了重要作用。但由于化肥的過量施用引起肥料利用率低、生態環境惡化等一系列的社會問題。為了減少化肥施用量，提高肥料利用率和緩解化肥對環境的污染，迫切需要研制一種新型肥料來替代部分化肥。生物有機肥是多種有益微生物菌群與有機肥結合形成的新型、高效、安全的微生物—有機復合肥料。它綜合了有機肥和復合微生物肥料的優點，能夠有效地提高肥料利用率，調節植株代謝，增強根系活力和養分吸收能力。因此，研究、開發并合理施用生物有機肥料不僅是獲得作物優質高產和提高土壤肥力的重要措施之一，也是保護生態環境、促進農業可持續發展的必然趨勢。
1生物有機肥的種類
生物有機肥料是指以畜禽糞便、秸稈、農副產品和食品加工的固體廢物、有機垃圾以及城市污泥等為原料，配以多功能發酵菌種劑加工而成的含有一定量功能性微生物的有機肥料。它既不是傳統的有機肥，也不是單純的菌肥，是二者的有機結合體。目前農業生產中有多種多樣的生物有機肥料。生物有機肥的原料廣泛，種類繁多，每種有機肥各有其特點，在生產實踐中充分了解其性質特點，在應用中才能取得良好的效果。按照不同的分類方法可以分成以下幾種類型。
1.1按其所含微生物的種類和性能不同分類單一功能生物有機肥包括固氮菌肥料、磷細菌肥料、解鉀菌肥料和硅酸鹽細菌肥料等。目前在美國、澳大利亞等發達國家豆科種植的80%以上都接種根瘤菌劑;但在我國豆科植物接種根瘤菌面積不足種植面積的1%，但都表現出了增產效應，有的地方增產在10%或更多。
多功能生物有機肥包括復合菌肥料。EM生物有機肥是接菌多功能菌種的一種多功能生物有機肥料。EM是日本硫球大學比嘉照夫教授于上世紀80年代初研究成功的一種新的復合型微生物制劑。EM是有效微生物群體之意，由10屬80多種有效微生物組成，以畜禽糞便為主料生產出來的一種復合型菌肥，在我國也生產及應用。
1.2按其生產工藝分類
菌肥：直接使用菌體的肥料。“生化液”：利用微生物代謝產物的商品。
1.3按其基質和形態不同分類
固體菌肥：以固體材料作為基質生產的生物肥料。
液體菌肥：以液體材料作為基質生產的生物肥料。
1.4根據產品中添加有機質載體的不同分類
利用麥草、雞糞生產生物有機肥、稻草生物有機肥、秸稈生物有機肥、酒糟生物有機肥、牛糞型生物有機肥、蔗渣灰生物有機肥、蠅蛆生物有機肥、葛根菌糠生物有機肥等。在生產實踐上還有多種這樣的生物有機肥料，有人將生物有機肥中加入無機肥料，制成有機無機生物有機肥。
