目前，我國還未出臺專門針對有機肥廠房的結構設計標準，在設計中，應滿足一般廠房結構設計標準的基礎上，兼顧有機肥廠房的特點進行確定。
（1）堆肥堆積的壓力
由于堆肥的堆積，作用于堆肥設施護墻產生的壓力，可利用土木工程學領域確立的護墻設計方法進行計算確定。
堆肥化設施的發酵槽，一般采用高度1.5～2.2m的鋼筋混凝土或混凝土塊建造護墻。設計護墻的強度時，首先要考慮由于堆肥堆積所帶來的壓力。
堆肥與一般的無機質土壤相比，有高水分、輕質、高壓縮性、低強度的特性，具有與土木工程學領域采用的有機質腐殖土類似的物理性質。據此分析，可采用土質工程學領域確立的護墻設計方法。
（2）作業機械的壓力
采用翻堆機進行翻堆作業的堆肥化設施，需考慮翻堆作業作用于發酵槽墻面的壓力來設計發酵槽墻壁的強度。
采用鏈板式翻堆設備時，槽間凈空應滿足翻堆機運行要求，防止翻堆過程中翻堆機與槽壁抹茶形成側向壓力。翻堆過程中翻堆設備對槽壁產生的影響主要來自翻堆設備自重和翻堆時的機械振動。
發酵槽的結構設計應同時滿足堆肥堆積壓力和作業機械壓力的雙重要求。
