有機肥的某些基質可能除了需要進行水分和孔隙調整外，還需其他的調節，如有些富纖維物質像庭院垃圾和部分城市固體廢物，可能缺少微生物快速增長的必需營養，所以，需對初始基質進行調節，以保證生物有合適的環境生長繁殖。
另外堆肥基質滿要一些無機營養來保證微生物的生長。在堆肥系統中氮的需求比其他無機營養物高，所以主要調節氮營養。
在好氧代謝過程中，微生物利用1份氮需耍15～30份碳，即C/N=15～30。如來C/N 增加，則堆肥時間延長，如C/N為20,堆肥需要12天，C/N為78，則需要21天。含氮量低會造成“氮”營養受限，限制微生物生長，影響整個堆肥進程?去除一部分高含碳物質或 (和）加人一些高含瓿物質可以解決商C/N的問題。
如果C/N≤15,則氮過量，不會出現氮限制的情況。堆肥文獻中通常認為混合基質的C/N必須在15～30范圍內，其實不然，只是C/N在15～30時可避免氮營養受限。當C/N 小于15時，過量的氮會隨氨揮發而損失。
應用C/N時一般假定碳源和氮源基質都是易降解的。需注意的是：對于難降解的有機氮，則不管C/N多少，這部分氮都是無效的。所幸的是，自然狀態下基質所含的氮絕大部分都是在蛋白質分子中，相對易降解。另外，如果存在難降解的碳源基質，即使是高C/N， 也不會影響堆肥進程，因為這部分碳幾乎不參與微生物的分解和合成。
