目前微生物肥料的定義大致有2種： 一種是狹義微生物肥料， 是指含有的特定微生物通過生命活動只是增加了植物所需營養(yǎng)元素的供應量， 使得植物營養(yǎng)狀況改善促進植物生長， 進而提高產量、 增加農產品品質， 如根瘤菌肥就是這類微生物肥料中的一種[1]。另
一種為廣義的微生物肥料， 也叫做復合微生物肥料， 指除了特定微生物外還含有其他營養(yǎng)物質， 通過含有微生物的生命活動， 不僅僅提高植物營養(yǎng)元素的供應水平， 而且微生物活動產生的一些次生代謝產物， 如植物生長激素等， 能夠促進植物對營養(yǎng)元素的吸收利用或
拮抗某些病原微生物， 減輕農作物病害而促進作物產量的增加。這一類的制劑較多， 比較復雜， 如植物根際促生菌(PGPR)。
微生物肥料的種類很多， 按照不同的分類方法可以分為4種：
（1） 按照制品中特定微生物種類可以分為細菌肥料 （如根瘤菌肥、 固氮、 解磷、 解鉀菌肥）、 放線菌肥料 （如抗生素菌肥）、 真菌類肥料 （如菌根真菌）、 光合細菌肥料、 復合菌劑肥料 （酵素菌肥） 等；
（2） 按照其作用機理分為增加植物營養(yǎng)為主的肥料、 刺激植物生長
為主的肥料、 抵抗植物病害為主的肥料、 農藥降解為主的肥料等；
（3） 按照肥料中添加菌種種類分為單一微生物肥料和復合微生物肥料， 其中復合微生物肥料中又含有菌菌復合， 菌和各種添加劑的復合；
（4） 從形態(tài)上分主要有液體肥料 （用于拌種、 葉面噴施）、 固體顆粒肥料 （用于基施或追施）。
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