用手推車或拖拉機把新鮮畜禽糞便倒入發酵大棚，厚度40cm左右，拌上微生物發酵菌劑和各種發酵輔料，每天開動翻拋機一個來回，沿軌道連續翻動拌好菌劑的畜禽糞便，使其發酵、脫臭，生畜禽糞便從發酵車間一端進入，出來時變為發酵好的有機肥。直接進入干燥設備脫水或經晾曬后，裝袋銷售。這種工藝是國內發展應用最多的一種模式，翻拋形式與配套的機器設備多種多樣，常見的有旋轉葉片、旋轉軌鏈、螺旋攪拌等形式。本方法的優點是充分利用光能、發酵熱，設備簡單，運轉成本低。
本方法的的缺點：(I)是占用場大，(2)發酵完的有機肥仍很濕，需經專門干燥設備干燥或晾曬后才能成為商品有機肥；(3)棚內空氣污濁、氣溫高，不利于工人操作。
1,圓筒發酵
將新鮮畜禽糞便拌入作物秸稈和微生物發酵菌劑，混合攪拌均勻，調節水分到55%左右，用料斗輸送裝入一臺橫放的大圓筒，簡為攪拌釜式結構，并充入40-45度熱蒸氣或熱空氣，物料在筒內經8h-lOh發酵后，再加溫到80度，持續 l小時以上，以殺滅細菌和蟲卵。本方法的優點是占地少，機械化程度高，發酵與干燥一體化。本方法的缺點是需要一定的設備投資，發酵不充分，發酵干燥的成本高。
2,塔式發酵
將新鮮畜禽糞便接種微生物發酵菌劑和發酵所需的各種輔料，攪拌均勻后經皮帶或料斗設備提升到一塔式多層的發酵倉內，在塔內經過翻板的翻動逐層下落和通風，快速發酵除臭、脫水，干燥形成商品有機肥。本方法的優點是充分利用了發酵產生的生物熱，發酵速度快，有利于干燥水分；機械化程度高，發酵條件容易控制；占地面積小。本方法的缺點是投資大，設備維修麻煩，能耗高。
3,膨化處理
將新鮮畜禽糞便經螺旋擠壓輸送到旋轉的烘干簡中，并用熱風爐向筒中輸送的高溫熱風，是新鮮畜禽糞便迅速干燥，并殺滅其中的病菌。本方法的優點是占地少，加工效率高，迅速消滅糞便中病原菌。本方法的缺點是加工過程排放的惡臭氣體對有環境污染，加工過程耗煤量大。
4,水解處理
向盛裝新鮮畜禽糞便的密閉發酵罐中通入水蒸氣，在高溫高壓下，使糞便迅速分解。本方法的優點：處理時間短，可在高溫高壓下殺滅病菌，將難于分解的有機物迅速分解成小分子物質。本方法的缺點：發酵產生氣體惡臭，處理后糞便中水分含量高，需耗費大量能源才能使其干燥。
