我國的有機肥技術也因產業需求由人工逐漸往機械化工藝發展。產業發展趨勢如下：

　　(一)翻拋機工藝

　　初期的堆肥生產過程僅仰賴人力實施，但為了提高效率，人們開始往兩方面發展：(1)開發替代人力的生產設備及(2)發酵劑。發酵劑主要功能成分為生物酶與益生菌群，可促進發酵、降低臭味，且達到縮短制程與提高質量之作用。在設備開發方面，上世紀中葉，德國巴克斯(Bacchus)公司首先研制出改善供氧和物料混合的機器設備，稱之為翻斗車。自此翻斗車在市場上迅速發展，成為處理畜禽糞便廢棄物的重要設備。而現代堆肥翻拋系統的開發可追溯于20世紀中期，以德國、美國等為代表，較早對翻拋系統投入研究。與傳統的堆肥方法相比較，機械化設備得到了廣泛的應用，同時采用了良好的堆肥工藝模式，進一步提高了堆肥的速度和處理量。我國最早的一臺翻拋機是在上世紀末(1994年)自德國巴克斯(Bacchus)公司引進，用于處理豬糞制成有機肥料。我國自本世紀初即逐漸盛行翻拋機，成為有機肥產業最重要的生產設備。經歷二十余年的發展，國內已有具備自行生產系列翻拋機能力，目前專業有機肥廠使用的翻拋機主要如下三種：

　　(1)槽式翻拋機：適用于槽式堆肥，通過槽內的翻拋裝置將物料翻拋均勻，促進發酵過程。此機種型號、規格多，目前占據翻拋機的最大市場份額。

　　(2)鏈板式翻拋機：通過鏈板結構將物料翻拋，具有翻拋面積大、深等特點，但單價往往高于槽式翻拋機。

　　(3)輪盤式翻拋機：也稱葉輪式翻拋機，適用于處理大量物料。翻拋橫跨寬度可依據需求定制，近年來市場份額有增加趨勢。

　　翻拋機的開發雖能使有機肥產業由人工至機械生產邁前一大步，但僅在“自然條件下”翻動原理達到混合原材料、提供通氣功能，其對于發酵反應的效益有限，因而以翻拋機為唯一發酵設備的工藝流程(雖有其他諸多設備，但皆與發酵無直接關聯，諸如攪拌機、干燥機、冷卻機、篩分機、輸送機、包裝機及造粒機等)，普遍呈現出，臭氣熏天、環境惡劣;且制程長(2~4個月)、產能小、占地廣及經濟效益低等為人詬病的缺點，并無法符合現階段產業需求與要求。

　　(二)有機肥(立式)發酵罐

　　有機肥發酵罐的發明可以追溯到19世紀70年代，德國微生物學家Schulze在其實驗室中發明了一種高效的發酵罐，此被視為現代實驗室發酵罐的前身。盡管早期的設備主要用于實驗室研究，但到了20世紀60年代，發酵罐也開始應用于有機肥產業之中。

　　相對于自然環境條件下進行發酵的翻拋機工藝，有機肥發酵罐設計原則在于，相對密閉空間，以人為能耗供應氧氣、持續攪拌、或提供熱能，并加入發酵劑，創造了優于自然環境的發酵條件。其優點可以大大縮短制程時間、減少臭味產生及用地面積，一度為國家編列購買設備補助款，極力推廣。但多年的產業實施，卻驗證因其成本過高(能耗、設備價格)、處理量小、質量難達預期效果等問題，無法產生實質的經濟效益，甚或產業價值不及翻拋機，而逐漸不被青睞。

　　(三)納米膜發酵技術

　　翻拋機及發酵罐工藝皆無法滿足我國每年龐大亟待處理的畜禽糞污及普遍貧瘠的耕地亟需大量有機肥改善的產業需求，因此依然需要開發或引進新設備工藝。國內現階段另一有機肥發酵工藝，“納米膜發酵技術”，最早出現于20世紀80年代的德國，是由Baden-Baden推出的好氧發酵靜態條垛堆肥方法。我國于本世紀初引進納米膜發酵技術，且逐漸有實施案例，其主要是利用會透氣，但防水的特殊材質覆蓋經調節水含量及碳氮比等的混合堆體，經過曝氣裝置提供氧氣。其優點包含：固定投資成本低(省卻大部分土建工程)、能耗低(具備保溫效果，無需提供額外熱源)、運行成本低(覆蓋后無需人工操作)。缺點是混料前處理，耗費人工與時間;發酵為靜置狀態，混料不均，影響成品質量;批次生產，一次性處理一定量(少則數十噸，多則上百千噸)，工藝流程間斷不易形成自動化流水線。